MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus E33L plasmid pE33L5

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007104	TTTTC	2	10	48	57	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007104	ATC	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007104	ATT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007104	TAT	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007104	TTA	2	6	209	214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007104	T	6	6	238	243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007104	TCT	2	6	302	307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007104	ACAA	2	8	338	345	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007104	TAT	3	9	394	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007104	AAT	2	6	429	434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007104	ATA	2	6	461	466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007104	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	67078322
13	NC_007104	ATT	2	6	503	508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078322
14	NC_007104	TACT	2	8	541	548	25 %	50 %	0 %	25 %	67078322
15	NC_007104	ACC	2	6	582	587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67078322
16	NC_007104	A	6	6	706	711	100 %	0 %	0 %	0 %	67078322
17	NC_007104	AGA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078322
18	NC_007104	A	6	6	771	776	100 %	0 %	0 %	0 %	67078322
19	NC_007104	AGA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078322
20	NC_007104	ATC	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078322
21	NC_007104	CTA	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078322
22	NC_007104	GAA	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078322
23	NC_007104	GAA	2	6	885	890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078322
24	NC_007104	ACAG	2	8	992	999	50 %	0 %	25 %	25 %	67078322
25	NC_007104	A	6	6	1003	1008	100 %	0 %	0 %	0 %	67078322
26	NC_007104	ATA	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078322
27	NC_007104	ATCA	2	8	1108	1115	50 %	25 %	0 %	25 %	67078322
28	NC_007104	TTATGG	2	12	1142	1153	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	67078322
29	NC_007104	ATA	2	6	1213	1218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078322
30	NC_007104	TAT	2	6	1247	1252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078322
31	NC_007104	CAAA	2	8	1392	1399	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007104	A	6	6	1397	1402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007104	TAAA	2	8	1438	1445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007104	AAC	3	9	1501	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007104	TAC	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007104	TAT	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007104	A	6	6	1555	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007104	A	8	8	1567	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007104	TAG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007104	GTA	3	9	1598	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007104	T	7	7	1665	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007104	ATTA	2	8	1687	1694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007104	TAA	2	6	1719	1724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007104	TTAAT	2	10	1725	1734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007104	ATT	2	6	1770	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007104	ATTT	2	8	1785	1792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007104	TC	3	6	1800	1805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007104	T	7	7	1821	1827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007104	TA	3	6	1897	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007104	A	7	7	1931	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007104	GT	3	6	1985	1990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007104	GGA	2	6	2023	2028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007104	AC	3	6	2039	2044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007104	TCC	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007104	TA	4	8	2296	2303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007104	A	6	6	2358	2363	100 %	0 %	0 %	0 %	67078323
57	NC_007104	AG	4	8	2433	2440	50 %	0 %	50 %	0 %	67078323
58	NC_007104	AG	3	6	2443	2448	50 %	0 %	50 %	0 %	67078323
59	NC_007104	CA	3	6	2450	2455	50 %	0 %	0 %	50 %	67078323
60	NC_007104	ATG	2	6	2505	2510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078323
61	NC_007104	ATT	2	6	2520	2525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078323
62	NC_007104	TG	3	6	2598	2603	0 %	50 %	50 %	0 %	67078323
63	NC_007104	T	6	6	2630	2635	0 %	100 %	0 %	0 %	67078323
64	NC_007104	CAA	2	6	2663	2668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67078323
65	NC_007104	AAG	2	6	2682	2687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078323
66	NC_007104	T	6	6	2695	2700	0 %	100 %	0 %	0 %	67078323
67	NC_007104	A	6	6	2701	2706	100 %	0 %	0 %	0 %	67078323
68	NC_007104	TGCA	2	8	2730	2737	25 %	25 %	25 %	25 %	67078323
69	NC_007104	GAA	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078323
70	NC_007104	CAAA	2	8	2815	2822	75 %	0 %	0 %	25 %	67078323
71	NC_007104	GTG	2	6	2901	2906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078323
72	NC_007104	A	6	6	2918	2923	100 %	0 %	0 %	0 %	67078323
73	NC_007104	A	6	6	3008	3013	100 %	0 %	0 %	0 %	67078323
74	NC_007104	AGT	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078323
75	NC_007104	CAA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67078323
76	NC_007104	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078323
77	NC_007104	AGA	2	6	3157	3162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078323
78	NC_007104	CAAG	2	8	3248	3255	50 %	0 %	25 %	25 %	67078323
79	NC_007104	TACA	2	8	3267	3274	50 %	25 %	0 %	25 %	67078323
80	NC_007104	ATGAA	2	10	3354	3363	60 %	20 %	20 %	0 %	67078323
81	NC_007104	ATT	2	6	3413	3418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078323
82	NC_007104	AAATGA	2	12	3490	3501	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078323
83	NC_007104	ACA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67078323
84	NC_007104	AAGAA	2	10	3565	3574	80 %	0 %	20 %	0 %	67078323
85	NC_007104	TGG	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078324
86	NC_007104	AGA	2	6	3759	3764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078324
87	NC_007104	TCTCTT	2	12	3844	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67078325
88	NC_007104	T	6	6	3906	3911	0 %	100 %	0 %	0 %	67078325
89	NC_007104	CAT	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078325
90	NC_007104	T	6	6	3945	3950	0 %	100 %	0 %	0 %	67078325
91	NC_007104	TAAA	2	8	3990	3997	75 %	25 %	0 %	0 %	67078325
92	NC_007104	TTC	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67078325
93	NC_007104	AAT	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078325
94	NC_007104	A	6	6	4152	4157	100 %	0 %	0 %	0 %	67078325
95	NC_007104	ACT	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078325
96	NC_007104	T	7	7	4246	4252	0 %	100 %	0 %	0 %	67078325
97	NC_007104	CTT	2	6	4253	4258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67078325
98	NC_007104	TTC	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67078325
99	NC_007104	TCT	2	6	4274	4279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67078325
100	NC_007104	TTC	2	6	4284	4289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67078325
101	NC_007104	TAA	2	6	4299	4304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078325
102	NC_007104	T	7	7	4313	4319	0 %	100 %	0 %	0 %	67078325
103	NC_007104	TCA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078325
104	NC_007104	T	7	7	4351	4357	0 %	100 %	0 %	0 %	67078325
105	NC_007104	CCT	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67078325
106	NC_007104	AAT	2	6	4486	4491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007104	TTAT	2	8	4578	4585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007104	TAG	2	6	4620	4625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007104	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007104	T	7	7	4656	4662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007104	A	7	7	4676	4682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007104	TCC	2	6	4693	4698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_007104	GTT	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007104	A	7	7	4994	5000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007104	T	7	7	5020	5026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007104	A	6	6	5046	5051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007104	TTATT	2	10	5052	5061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007104	TAA	2	6	5071	5076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007104	TTA	2	6	5084	5089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.